ÁP DụNG Kĩ THUậT In Silico THIếT Kế PRIMER CHẩN ĐOáN VIRUS CHIKUNGUNYA
ÁP DụNG Kĩ THUậT In Silico THIếT Kế PRIMER CHẩN ĐOáN VIRUS CHIKUNGUNYA
VŨ XUÂN NGHĨA, NGUYỄN TRỌNG VIỄN,
PHẠM ĐỨC MINH, HOÀNG VĂN LƯƠNG
TÓM TẮT
Primer có vai trò then chốt trong kỹ thuật PCR. Để thiết kế các oligo ứng dụng trong chẩn đoán virus chikungunya, chúng tôi áp dụng kĩ thuật in silico. Dựa trên cơ sở dữ liệu (CSDL) genome ba loại virus, virus Chikungunya (CHIKV), virus Dengue (DENV) và virus O’Nyon-nyon (ONNV)
cùng 4 nhóm chương trình máy tính, UniproUGENE, ClustalX; HMMER và BLAST đã thiết kế được sáu oligo. Những oligo này đều cho thấy độ đặc hiệu và khả năng bắt cặp cao với CHIKV, không bắt cặp chéo với DENV và ONNV.
Hy vọng sẽ giúp ích cho các bạn, cũng như mở ra con đường nghiên cứu, tiếp cận được luồng thông tin hữu ích và chính xác nhất