Bằng chứng về sự không liên quan giữa gen interferon regulatory factor (irf) 5 và nguy cơ bị bệnh thận iga

Interferon regulatory factor (IRF) là một gia đình mang yếu tố phiên mã với 9 thành viên, trong số 9 IRF ở người, IRF5 được biết đến như một thành phần quan trọng trong quản lý của các kích hoạt tế bào miễn dịch và thích ứng miễn dịch [1; 2]. Những quan sát còn cho thấy IRF5 liên quan đến cảm ứng của cytokine trong hệ thống miễn dịch, do đó sự khác biệt của trình tự sắp xếp trong cấu trúc gen có thể ảnh hưởng đến chức năng của gen IRF5. Trong những nghiên cứu gần đấy cho thấy, một số điểm biến đổi của gen IRF5 có liên quan với các bệnh tự miễn dịch khác nhau. Điểm biến đổi ở gen IRF5 đã được chứng minh là một yếu tố nguy cơ cho sự phát triển lupus ban đỏ hệ thống (SLE) [3; 4; 5; 6; 7], viêm khớp dạng thấp (RA) [8; 9; 10; 11], đa xơ cứng [12], hội chứng Sjogren [13] và bệnh viêm đường ruột [14]. Do đó gen IRF5 được đề xuất như là một gen quan trọng tham gia vào cơ chế bệnh sinh của các bệnh tự miễn dịch. Bệnh thận IgA là một trong những viêm cầu thận hay gặp nhất trên thế giới, tỷ lệ khoảng 30 trường hợp mắc mới mỗi năm trong một triệu người ở quần thể người da trắng [15]. Chan đoán xác định bệnh là sinh thiết thận cho thấy sự lắng đọng của IgA tại gian mạch cầu thận [16]. Tuy nhiên, chưa có nghiên cứu hệ thống nào về mối liên quan giữa IRF5 và bệnh thận IgA. Nghiên cứu của chúng tôi được thực hiện nhằm mục tiêu tìm hiểu, xác định mối liên quan giữa gen IRF5 và bệnh thận IgA.
II.    Đối tượng và phương pháp
1.    Đối    tượng nghiên cứu
Nghiên cứu được thực hiện trên 212 bệnh nhân bệnh thận IgA đã được chan đoán xác định bằng sinh thiết thận và 477 người khỏe mạnh làm nhóm chứng. Bệnh nhân Henoch-Schõnlein được loại trừ ra khỏi nghiên cứu.
2.    Tách chiết DNA, lựa chọn marker và phương pháp xác định kiểu gen
DNA được tách chiết từ mẫu máu toàn phần có EDTA (5 – 10 ml) bằng phương pháp “salting out”. Các SNPs (singe nucleotide polymorphisms) của gen IRF5 được lựa chọn đều là những SPNs đã được chứng minh có vai trò quan trọng trong các bệnh tự miễn.
Kiểu gen của các SPNs được thực hiện bằng phương pháp fluorescent single base extension sử dụng máy multiplex SNPstream system (Beckman Coulter Inc). Tất cả các maker phân tích đều trong chuẩn Hardy-Weinberg equilibrium và tỷ lệ xác định kiểu gen thành công trung bình là 97,2%. Các mẫu DNA với chất lượng không tốt cho xác định kiểu gen (tỷ lệ thành công < 95%) được loại khỏi phân tích.
Test X bình phương và Fisher’s exact test được áp dụng để so sánh tỷ lệ phần trăm kiểu gen, allele và kiểu hình với phần mềm SPSS. Haplotype được phân tích bằng chương trình HaploView [17].
III.    Kết quả
l.Tỷ lệMAFvà thông tin của các SNPs thuộcgen IRF5 trong bệnh thận IgA
Bảng 1: Thông tin về các SNPs thuộc gen IRF5 trong bệnh thận IgA