Biến động genotype của Norovirus lưu hành tại miền Bắc Việt Nam từ 2007 – 2013

Biến động genotype của Norovirus lưu hành tại miền Bắc Việt Nam từ 2007 – 2013: Xuất hiện các subgenotype GII.4 mới nhưng vẫn duy trì tương tác kháng nguyên nhóm máu
Tác giả: Vũ Thị Bích Hậu, Đặng Đức Anh, Nguyễn Vân Trang
Tóm tắt:
Nghiên cứu giám sát trên hơn 1800 mẫu phân tiêu chảy tại bệnh viện ở một số tỉnh miền Bắc nước ta từ 2007 đến nay cho thấy NV GII.4 là genotype lưu hành phổ biến nhất (74,5%), kế tiếp là genotype GII.3 (20%). Sự biến động đáng kể và nhanh chóng của chủng NV GII.4 trong thời gian ngắn với các đa dạng chủng khác nhau bao gồm: Nhóm 2006b chiếm ưu thế trong những năm 2007-2008 đã dần thay thế bởi nhóm Sydney-2012 trong năm 2013. Genotype GII.4 nhóm New Orleans-2009 tồn tại trong giai đoạn 2010-2012 và không xuất hiện trong năm 2013. Sự khác biệt trình tự axit amin gen capsid VP1 của vi rút giữa các chủng NV GII.4 nhóm 2006b, New Orleans-2009, Sydney 2012 dao động từ 6-9%, tuy vậy amino acid tại các vị trí tương tác với thụ thể kháng nguyên nhóm máu không thay đổi. Tương tự với NV-GII.4, vị trí tương tác với kháng nguyên nhóm máu của các chủng GII.3 ở nước ta từ 2007-2013 có sự ổn định với sự khác biệt trong trình tự axit amin là 3-5% giữa các chủng. Như vậy, cùng một lúc tồn tại sự đa dạng di truyền của 2 genotype NV này nhưng bền vững trong tương tác với tế bào vật chủ. Điều này giải thích khả năng lưu hành trong thời gian dài của 2 genotype này ở nước ta, tương tự với đặc điểm chủng NV lưu hành trên thế giới.