Nghiên cứu phát hiện giảm điều hoà gen trong mô ung thư đại trực tràng bằng công nghệ microarray

Nghiên cứu tiến hành đánh giá và so sánh biểu hiện gen trên 62 mẫu mô từ bệnh nhân (BN) ung thư đại trực tràng (UTĐTT) được xác chẩn qua sinh thiết sau phẫu thuật, trong đó có 39 mẫu mô ung thư và 23 mẫumô tổ chức xakhối u. Táchchiết ARN tổng số từ mô ung th-và mô lành. cADN, ARN,đ-ợc tổng hợp,tinh sạch RNA sửdụng bộ kit Ambion Illumina TotalPrep ARN Amplification Kit theo quy trình của nhà sản suất. Lai cARN lên chip sử dụng Sentrix(R)

BeadChip HumanRef-8_V2, Illumina,Mỹ, 22185 gen. Rửa và phát hiện tín hiệubằng Stepavidin-Cy3. Scan hình ảnh lai cARN trên chipcủa hệ thống trên hệ thống Illumina Bead array reader, Bead Station 500X. Phân tích kết quả bằngphần mềm Beadstudio V1.5.1.3 và phần mềm trực tuyến DAVID. Sosánh biểu hiện gen đ-ợc giữacác mẫu môung th-vàmẫu mô xatổ chức ung thư mô lành. Kết quả phát hiện43 gengiảm biểuhiện ở mô ung th-so với môlành (p < 0,01). 

Trong những năm gần đây tỷ lệ mới mắc ung th- đại -trực tràng(UTĐTT)tăng nhanh ở nước ta từ 9,2 lên 11, 8/100.000 ở namgiớivàtừ 6,4 lên8,3/100.000ở nữgiớitừ1990 đến 2002. Năm 2002 cản-ớc có 6.029 BNmới mắc UTĐTT. 

Là một bệnh diễnbiến thầm lặng, triệutrứng nghèo nàn và th-ờng lẫn với các triệu trứng rối loạncơ năng vàthực thể của cácbệnh lý đường tiêu hoá khác nên ít đ-ợc chú ý, dễ bỏ qua,biểu hiệnrõhơnkhi bệnh đãnặng. Mặc dù hiệnnaycó nhiều ph-ơng pháp chẩn đoán hiện đại, nhưng tỷ lệ phát hiện UTĐTT sớm vẫn rất thấp. ở n-ớc ta, cho đến nay mới chỉ đề cập đến biến đổi một vài gen riêng lẻ, ch-a có một công trình nào nghiên cứu cách có hệ thống và đầy đủ về biến đổi gen trong 

UTĐTT cũng như mối liên quan của biến đổi này với đặc điểm lâm sàng, nội soi, mô bệnh học. Xuất phát từ thực tế đó chúng tôi tiến hành đề tài này nhằm mục tiêu: 

Khảo sát sự biểu hiện của các gen trong genome ng-ời trong tổ ở UTĐTT bằng kỹ thuật microarray