Nghiên cứu sự biến đổi biểu hiện gen giữa ung thư đại trực tràng có di căn hạch và không di căn hạch bằng phương pháp microarray

Nghiên cứu đánh giá và so sánh biểu hiện gen trên 7  mẫu mô từ  bệnh nhân (BN) ung thư đại  trực tràng  (UTĐTT) có di căn hạch và 32  mẫu mô từ  BN UTĐTT không di căn hạch được xác chẩn  qua sinh thiết sau phẫu thuật nhằm đánh giá biến đổi biểu hiện gen giữa hai loại. Tách chiết ARN  tổng số  từ  mô ung thư và mô lành. Tổng hợp cADN, ARN, tinh sạch ARN sử  dụng bộ  kit Ambion  Illumina TotalPrep RNA Amplification theo quy trình của nhà sản suất.  Lai cARN lên chip sử  dụng  Sentrix (R)
BeadChip  HumanRef-8_V2,  Illumina  (Mỹ),  22.185  gen.  Rửa  và  phát  hiện  tín  hiệu  bằng  Stepavidin-Cy3. Quét hình  ảnh lai cARN trên chip trên hệ  thống Illumina Bead array reader, Bead  Station 500X. Phân tích kết quả  thu được  bằng phần mềm Beadstudio V1.5.1.3 và phần mềm trực  tuyến DAVID. Kết quả  cho thấy: 17 gen tăng biểu hiện và 5 gen giảm biểu hiện ở  mô ung thư có di  căn hạch so với mô ung thư chưa có di căn hạch (p < 0,05).