NGHIÊN CỨU TOÀN BỘ TRÌNH TỰ GEN PAGA TRÊN MỘT SỐ CHỦNG BACILLUS ATHRACIS PHÂN LẬP Ở MIỀN BẮC VIỆT NAM

by

NGHIÊN CỨU TOÀN BỘ TRÌNH TỰ GEN PAGA TRÊN MỘT SỐ CHỦNG BACILLUS ATHRACIS PHÂN LẬP Ở MIỀN BẮC VIỆT NAM

 NGHIÊN CỨU TOÀN BỘ TRÌNH TỰ GEN PAGA TRÊN MỘT SỐ CHỦNG BACILLUS ATHRACIS PHÂN LẬP Ở MIỀN BẮC VIỆT NAM

Đinh Thị Thu Hằng*; Nguyễn Thái Sơn**
TÓM TẮT
Mục tiêu: nghiên cứu trình tự đầy đủ gen pagA (protective antigen gene) mã hóa kháng nguyên bảo vệ PA (protein quan trọng tham gia tạo độc tố bệnh than) trên một số chủng Bacillus anthracis có độc lực phân lập ở miền Bắc Việt Nam. Vật liệu và phương pháp: 3 chủng B. anthracis do Viện Y học Dự phòng Quân đội cung cấp. Tách chiết và khuếch đại chính xác ADN tổng số từ dịch nuôi cấy sau khi đã bất hoạt bằng nhiệt sử dụng cặp mồi đặc hiệu. Toàn bộ gen pagA được tách dòng trong vector pJET1.2/blunt, lựa chọn các plasmid tái tổ hợp mang gen mong muốn và phân tích trình tự. Kết quả và kết luận: đã tách dòng và giải trình tự toàn bộ gen pagA của 3 chủng B. anthracis có độc lực. Xác định được 3 đột biến điểm (TC), gồm 1 đột biến đồng nghĩa (TC)195 và 2 đột biến sai nghĩa (TC)1693, (TC)1799 khi so sánh với trình tự tham chiếu B. anthracis Vollum-USA. Đột biến (TC)1693 xuất hiện trên cả 3/3 chủng B. anthracis nghiên cứu. Còn 2 đột biến là (TC)195 và (TC)1799 tìm thấy ở cả 2 chủng 4NS, 1C3. Gen pagA rất bền vững, không có sự khác biệt đáng kể giữa các chủng B. anthracis nghiên cứu ở Việt Nam và thế giới
TÀI LIỆU THAM KHẢO
1. Nguyễn Ngọc Bảo, Đoàn Trọng Tuyên, Nguyễn Xuân Thành. Nghiên cứu đặc điểm di truyền phân tử một số yếu tố độc lực của chủng Bacillus anthracis lưu hành ở khu vực miền núi phía Bắc Việt Nam. Hội nghị Khoa học Công nghệ Sinh học toàn quốc 2013. 2013, tr.594-598.
2. Phạm Thúy Kiều, Nguyễn Thị Ánh Nguyệt, Nguyễn Đình Tuấn. Tách dòng và đọc trình tự gen pagA mã hóa kháng nguyên bảo vệ PA từ chủng VK Bacillus anthracis VCM1167. Công nghệ Sinh học. 2006, 4 (4), tr.447-454.
3. Daligault HE, Davenport KW, Minogue T et al. Twenty Whole-Genome Bacillus sp. Assemblies. Genome Announc. 2014, 2 (5).
4. Jung KH, Kim SH, Kim SK et al. Genetic populations of Bacillus anthracis isolates from Korea. J Vet Sci. 2012, 13 (4), pp.385-393.
5. Letant SE, Murphy GA, Alfaro TM et al. Rapid-viability PCR method for detection of live, virulent Bacillus anthracis in environmental samples. Appl Environ Microbiol. 2011, 77 (18), pp.6570-6578

 

Hy vọng sẽ giúp ích cho các bạn, cũng như mở ra con đường nghiên cứu, tiếp cận được luồng thông tin hữu ích và chính xác nhất

Leave a Comment