Phân tích in-silico trên một số chủng vi rút Seoul lưu hành quần thể Rattus norvegicus ở miền nam Việt Nam, 2007- 2009

Phân tích in-silico trên một số chủng vi rút Seoul lưu hành quần thể Rattus norvegicus ở miền nam Việt Nam, 2007- 2009
Tác giả: Vũ Đình Luân, Yoshimatsu Kumiko, Bùi Chí Tâm, Nguyễn Thị Công Dung, Huỳnh Phương Thảo, Vũ Thiên Thu Ngữ, Cao Minh Thắng, Huỳnh Thị Kim Loan, Endo Rika, Jiro Arikawa, Vũ Thị Quế Hương, Phan Trọng Lân
Tóm tắt:
Với các nghiên cứu gần đây nhóm tác giả Viện Pasteur thành phố Hồ Chí Minh (TP.HCM) đã cung cấp những bằng chứng đầu tiên về sự lưu hành của chủng vi rút Seoul (SEOV): CSG5 và CSG11 ở cả trên cộng đồng lẫn quần thể động vật truyền bệnh. Dựa trên nền tảng đáng tin cậy đó, nghiên cứu in-silico này tập trung vào việc xác định và mô phỏng hóa những đặc tính sinh học trên hai thành phần protein quan trọng (nucleocapsid –N protein và glycoprotein – G protein) của các chủng CSG5 và CSG11. Kết quả phân tích xác định rõ sự tồn tại của cấu trúc trimer theo mô hình Coil-coil các protein N có vai trò thiết yếu trong quá trình sao chép của vi rút. Đồng thời, một trình tự Immunoreceptor tyrosine-based activation motif (ITAM) cũng như 5 vị trí N-glycosyl đặc biệt quan trọng trong quá trình biến đổi sau dịch mã và quyết định khả năng kích ứng hệ thống miễn dịch của vi rút cũng được xác định trên G protein