XÂY DỰNG QUY TRÌNH GIẢI TRÌNH TỰ GEN MUTYH
XÂY DỰNG QUY TRÌNH GIẢI TRÌNH TỰ GEN MUTYH
Nguyễn Hữu Huy*, Nguyễn Huỳnh Minh Quân*, Lê Xuân Trường **, Lê Minh Khôi**, Nguyễn Thị Băng Sương**
TÓM TẮT :
Mở đầu: Gen MUTYH là gen mã hóa cho enzyme glycosylase MUTYH có chức năng sửa chữa DNA bị hư hại do oxy hóa theo cơ chế sửa sai cắt bỏ base. Đột biến gen MUTYH sẽ gây ra bệnh đa polyp liên quan đến gen MUTYH (MAP – MUTYH -associated polyposis) và làm tăng nguy cơ mắc nhiều bệnh ung thư đặc biệt là ung thư đại trực tràng. Các đột biến trên gen MUTYH chủ yếu là đột biến điểm nên phương pháp phát hiện hiệu quả nhất là giải trình tự gen.
Mục tiêu: Nghiên cứu xây dựng quy trình giải trình tự gen MUTYH
Đối tượng – Phương pháp nghiên cứu: 10 mẫu máu của 10 người bình thường, nội soi không có polyp đại trực tràng. DNA genome được tách chiết bằng kit QIAamp DNA Blood Mini và dùng làm bản mẫu cho phản ứng PCR. 9 cặp mồi được thiết kế bằng các phần mềm chuyên dụng và phản ứng được tối ưu hóa nhằm khuếch đại 16 exon của gen MUTYH. Sản phẩm PCR được giải trình tự trình tự và so sánh với trình tự gen MUTYH từ cơ sở dữ liệu NCBI.
Kết quả: Sau khi thiết kế và chọn được trình tự mồi thích hợp, phản ứng PCR được tối ưu ở nhiệt độ bắt cặp là 58 oC và độ nhạy của quy trình là 10 ng/ μl DNA genome. Kết quả sản phẩm giải trình tự hoàn toàn tương đồng với trình tự gen MUTYH từ cơ sở dữ liệu NCBI.
Kết luận: Xây dựng thành công quy trình giải trình tự gen MUTYH
Hy vọng sẽ giúp ích cho các bạn, cũng như mở ra con đường nghiên cứu, tiếp cận được luồng thông tin hữu ích và chính xác nhất